设施
约翰霍普金斯大学医学院为研究生学习提供了良好的环境. 高质量的研究和培训活动吸引了优秀的学生和优秀的年轻教师,同时保持了杰出的高级教师队伍. 因此,环境非常有利于和支持研究活动. 几乎每天都, 研究研讨会由来访的科学家介绍最新的研究进展, 不管它起源于哪里, 是沟通. 我们的教师是科学期刊的编辑和审稿人,严肃研究的氛围无处不在.
![学生们在看一缸斑马鱼](/-/media/institute-genetic-medicine/predoctoral-human-genetics-students-4.jpg)
医学院和医院的环境特别适合人类生物学的研究训练. 医学院是唯一的人类生物学学校,约翰霍普金斯大学医学院是了解人类表型的最佳场所之一. 基础科学教员是杰出的人类生物学家(遗传学家), 生理学家, 药理学家, 细胞生物学家和生物化学家)和临床教师是人类变异和疾病方面的专家.
运输
几个 航天飞机服务 提供连接霍普金斯大学校园和周边地区的交通工具.
研究机构
研究设施包括设备齐全的分子生物学实验室, 细胞培养, 生物化学和免疫遗传学. 还提供最先进的计算机设施, 韦尔奇医学图书馆, with an outstanding collection on 遗传学; and facilities on the Homewood campus including the Johns Hopkins University Eisenhower Library. 爱德华·D. 米勒研究大楼, IGM在哪里, 也有一个国家的最先进的vivarum与广泛的空间,致力于动物研究, 主要是啮齿动物.
除了实验室和部门设备, 一些机构的核心设施可供学生使用. 其中一些在培训后可供用户使用,而另一些则是按服务收费.
约翰霍普金斯基因组学遗传学、基因组学和生物信息学的主要研究中心. 它是约翰霍普金斯医学院所有校区的临床遗传学实验室,也是世界上最大的研究基因分型和测序中心之一. mckusick - nathan遗传医学系和病理学系的合作, 约翰霍普金斯基因组公司成立于2015年,旨在集中最新的基因组研究, 最高质量的临床检测, 以及卓越的分析和解释专业知识. 我们的使命是促进对人类疾病的理解和治疗, 遗传的和获得的, 为我们的推荐十大正规网赌平台和约翰·霍普金斯大学的同事以及其他地方的同事提供帮助. 我们的中心总部位于巴尔的摩阿什兰大道1812号新建的, 最先进的实验室设施. 我们在约翰霍普金斯医院也有分支机构. 我们的实验室单位包括:DNA诊断实验室(临床生殖系检测), 分子诊断实验室(临床癌症检测), 细胞遗传学(生殖系临床检测), 癌症, 以及产前染色体异常), 遗传资源核心设施(研究服务), 磋商, 和cap认可的生物储存库), 以及遗传疾病研究中心(高通量基因分型和测序), 统计遗传学, 和无与伦比的生物信息学). 我们的设备包括最新的NGS,单分子测序和基因分型平台. HGG项目联合主任. Kim Doheny是JH基因组公司的联合主管, 为先进的基因组学提供了丰富的机会, 生物信息学, 并为学员提供临床诊断实验室经验.
斑马鱼核心中心斑马鱼被安置在我们现代化的1500平方米的空间里. ft. 在MRB共享DGM斑马鱼设施. Dr. Andrew McCallion是该设施及其功能遗传学(FInZ) CORE的联合主任. 该设施包括准备食物和更换水箱的空间, 还有放置显微镜的工作台,用于胚胎分拣和执行体外受精等程序. 该设施配备了23架水生生境连续流动系统,具有连续水质监测和自动加药,以维持恒定的pH和盐度. 该系统的总容量为4000个储罐.
生物统计学的核心:与生物统计中心合作, 临床和转化研究所提供与研究相关的咨询服务. 顾问可以协助:研究研究设计, 数据采集系统和仪器的设计, 数据输入和验证, 数据管理和质量保证, 统计分析和数据解释, 以及专业、科学的报告写作.
计算生物学中心计算生物学中心(CCB)是一个致力于基因组学研究的多学科中心, 遗传学, DNA测序技术, 以及DNA和RNA序列分析的计算方法. CCB汇集了来自各个领域的科学家和工程师, 开发和应用使用序列数据的技术.
CryoEM核心:通过单粒子冷冻电子显微镜和断层扫描对蛋白质、蛋白质和核酸复合物进行高分辨率结构研究的仪器和支持人员.
JHMI转录组学核心: NextGen测序从各大测序平台的文库建设到数据分析, 以及mRNA-seq, ChIP-seq, Single-Read, Paired-End读, Mate-pair, 使用安捷伦Sure-Select技术进行定向重测序, 条形码多路复用. 多平台微阵列服务包括Affymetrix, 安捷伦科技公司, 罗氏/罗氏, 和Exiqon及其相关设备.
JHMI合成 & 测序的核心: DNA合成和纯化, 自动DNA测序, 肽的合成与纯化, 蛋白/多肽测序分析.
马里兰高级研究计算中心(MARCC)蓝蟹是MARCC的主要集群,有超过23个,000核心(2018年6月),综合理论性能超过1.4 PFLOPs. 计算节点结合Ivy Bridge(大内存节点), Haswell, Broadwell和Skylake处理器和多个Nvidia K80/P100 gpu通过FDR-14 InfiniBand互连连接. 它还具有两种类型的存储:2 PB Lustre (IEEL)和14 PB Linux上的ZFS. 标准计算节点为Intel Xeon E5-2680v3 (Haswell), 每个CPU 12核), v4 (Broadwell e5 - 2690, 每个CPU 14核)和Gold 6126 (Skylake), 每个CPU 12核)和128/96 GB DDR4, 2.5/2.6/2.6ghz(标识TDP频率)或2.1/2.6/2.3ghz AVX2(AVX512)基频. 大内存节点是戴尔PowerEdge R920服务器与四英特尔“常春藤桥”至强E7-8857v2, (3.0GHz, 12核,30MB, 130W). 每个节点的内存为1024gb.
质谱法和蛋白质组学核心提供最先进的蛋白质组学服务和资源, 包括:质量测量, 结构分析, 蛋白质识别, 翻译后修饰位点分析. 设备包括QSTAR/脉冲星和LCQ Deca XP电喷雾和旅行者DE-STR MALDI质谱仪, Nanospray源, 最终/ Switchos Famos高效液相色谱法, 验船师高效液相色谱, LCQ的AP MALDI源代码, IPGPHor和Ettan dalt6电泳装置, 伊坦点拾取器, 消化器和观察员, 和台风9400激光扫描仪. 提供了实验设计建议, 课程和培训,以便感兴趣的用户可以分析自己的样本.
显微镜设备:设备包括2台透射电子显微镜(Philips/FEI BioTwinCM120和日立7600), 扫描电子显微镜(Leo/蔡司场发射), 3扫描点激光共聚焦显微镜(蔡司LSM780-FCS), LSM700, LSM510元), 两台激光旋转盘共聚焦显微镜(3i Marianis/蔡司活细胞和3i/徕卡旋转盘), 多光子共聚焦(蔡司710NLO Meta), 带TIRF和显微注射站的荧光显微镜, 高压冷冻机和冷冻替代系统, 一般使用显微镜进行组织学和解剖. 目前正在安装一台激光光片显微镜.
分子成像中心和小动物成像: PET, SPECT-CT, CT, 光学成像(生物发光和荧光), 核磁共振和光谱成像, 超声波, Faxitron(高对比度、高倍率), 辐照柯达多光谱成像, NMR和EPI-MS谱分析. MRI服务中心:磁共振成像、光谱学、功能成像. Two 1.5台带有光谱的特斯拉成像仪可供选择,其中3台为3.特斯拉成像仪即将加入. 多光子成像核心:配备广泛的成像硬件阵列, including: Zeiss LSM 800 microscope with three GaAsP detectors and AiryScan; a Zeiss LSM 880 multiphoton microscope with multiple lasers, AiryScan, 延时成像能力, and a near-infrared (IKR) tunable femtosecond Ti-Sapphire laser; a Zeiss 710 multiphoton microscope suitable for awake behaving mouse imaging with multiple lasers, 红外成像能力, a binary GaAsP (BIG) detector and long working distance objectives; a Discovery Laser and Thorlabs Bergamo Multiphoton Microscope; custom, interchangeable temperature-controlled stages; a piezoelectric focus drive for rapid z-focus control; a Zeiss Cell Observer microscope; a Keyence benchtop widefield microscope; a Stereo Zoom Microscope equipped for fluorescent and transmitted light imaging; a stereotaxic surgery station; a 3D printer; and Imaris, Neurolucida, Autoquant, 和Zen成像软件.
PhenoCore:病理支持, 动物模型病理生物学及评价, 表现型的策略, 尤其是对转基因老鼠.
蛋白质微阵列核心:全人类蛋白质组微阵列和分析设计.
罗斯大楼流式细胞仪核心设备 为霍普金斯大学的研究人员提供流式细胞术和高速细胞分选.
单细胞/细胞核和数据科学核心数据科学核心提供端到端的实验和计算专业知识:初始实验设计和功率研究, 持续的数据生成和分析, 多维数据生成和最终数据沉积与共享. 数据科学核心将支持高数据分析, 包括不同生物尺度的多组学数据整合方法.
合成的核心:不同生物尺度组学数据整合方法. 小分子合成、纯化及表征.
转基因小鼠核心: CRISPR/Cas9诱变, 原核注射产生转基因小鼠, 胚泡注射产生敲除/在m冰, 胚胎低温保存, rederivitation, 聚合嵌合体, 新的小鼠胚胎干细胞系的衍生, 胚胎干细胞靶向, 还有倍性分析.
x光核心提供晶体或射线衍射和散射中生物大分子结构研究的能力.